根据个人所得税法规定，在两处以上取得工资薪金所得，应分别在工资薪金支付方预扣预缴个人所得税，其中基本减除费用5000元只能在一处选择扣除。

预扣预缴个人所得税计算公式为：本期应预扣预缴税额=（累计应预扣预缴应纳税所得额*预扣率—速算扣除数）—累计减免税额—累计预扣预缴税额

累计应预扣预缴纳税所得额=累计收入—累计减免收入—累计减除费用—累计专项扣除—累计专项附加扣除

个人所得税法实施条例规定，从两处以上取得工资薪金，向扣缴义务人提供专项附加扣除信息时，对同一专项附加扣除项目一个纳税年度内只能选择一处进行扣除。