1、适用范围。一般纳税人提供应税服务适用一般计税方法计税，而小规模纳税人提供应税服务适用简易计税方法计税。一般纳税人发生财政部和国家税务总局规定的特定应税行为，可以选择适用简易计税方法计税，但一经选择，36个月内不得变更。

2、应纳税额。一般计税方法的应纳税额，是指当期销项税额抵扣当期进项税额后的余额。应纳税额计算公式：应纳税额=当期销项税额－当期进项税额。销项税额，是指纳税人提供应税服务按照销售额和增值税税率计算的增值税额。销项税额计算公式：销项税额=销售额×税率。进项税额，是指纳税人购进货物或者接受加工修理修配劳务和应税服务，支付或者负担的增值税税额。

3、税率区别。简易计税办法使用的税率一般以3%较为常见，在营改增之后，某些行业存在5%的简易征收率；一般计税方法使用的税率根据使用情形涉及17%、11%、6%等不同税率。

4、是否抵扣。适用简易计税方法，不得抵扣进项税额；采用一般计税方法的通常可以抵扣进项税额。

特别的是，适用一般计税方法的纳税人,兼营简易计税方法计税项目而无法划分不得抵扣的进项税额，按照下列公式计算不得抵扣的进项税额：不得抵扣的进项税额=当期无法划分的全部进项税额×当期简易计税方法计税项目销售额÷当期全部销售额。主管税务机关可以按照上述公式依据年度数据对不得抵扣的进项税额进行清算。

5、是否开具专票。适用按3%简易计税办法计算缴纳增值税的项目，除明文规定不得对外开具增值税专用发票外，小规模纳税人可向税务机关申请代开增值税专用发票；而采用一般计税方法的一般纳税人通常可以开具增值税专用发票。