特别提款权与普通提款权有以下三点重要区别：

第一、特别提款权是国际货币基金组织根据份额分配给会员国的一重资产，会员国可自由支配和使用；普通提款权是基金组织根据会员国交纳份额给予提款的权利，最大额度不超过所交份额的125%，其信用部分不能自由提取。

第二、使用特别提款权等于在行使使用资金的权利，是种支出，是资产的减少。使用普通提款权等于在使用取得信贷的权利，是重借入，是负债的增加。

第三、使用特别提款权后不用偿还，普通提款权通常3-5年后需要偿还。