《担保法》第34条第1项规定，抵押人所有的房屋和其他地上定着物，可以抵押。但《担保法》第37条第2项规定，耕地、宅基地等集体所有的土地使用权，不得抵押。由于《担保法》禁止用农村宅基地设定抵押。

按照上述规定，虽然以宅基地上的房屋抵押是有效的，但是抵押权的效力不能及于该房屋占用范围内的宅基地使用权，一旦债务人不能清偿债务，债权人就只能以抵押房屋的建筑材料作为动产优先受偿。将房屋拆除而以建筑材料还债，这无疑大大降低了房屋的价值，也是一种浪费。

最高人民法院《关于人民法院民事执行中查封、扣押、冻结财产的规定》第6条规定：“对被执行人及其所扶养家属生活所必需的居住房屋，人民法院可以查封，但不得拍卖、变卖或者抵债。”据此，用农村房屋设定抵押，债权人实现抵押权也存在障碍。

另外，国土资源部《关于加强农村宅基地管理的意见》中规定：“严禁城镇居民在农村购置宅基地，严禁为城镇居民在农村购买的住宅发放土地使用证。”