先天性疾病是不赔的。建议可以看下自己的保险合同，根据保险合同，先天性疾病、遗传性疾病均属于免责范围。众所周知，保险是对未确定的风险所提供的保障，而先天性疾病属于投保前已确定的风险，所以就不可能列入健康险保障范围了。

保险合同条款中保险责任免除项，其中先天性畸形、变形和染色体异常是除外责任的，而这个解释是指被保险人出生时就具有的畸形、变形和染色体异常，所以即便是投保时过失未如实告知，商业保险也是不予赔付的。